Taller GBIF.ES: Estandarización y publicación de datos de biodiversidad marinos en GBIF y en revistas científicas (data papers)
Descripción
Este taller teórico-práctico de Estandarización y publicación de datos de biodiversidad marinos tiene como objetivo enseñar a los participantes a estandarizar y publicar datos de biodiversidad marinos a través de la red GBIF. Se abordarán aspectos relativos a la calidad, limpieza y depuración de los datos, estandarización y publicación a través de la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT), así como la preparación de manuscritos para la publicación de data papers. El taller de Estandarización y publicación de datos de biodiversidad marinos está dirigido a biólogos, conservadores de colecciones de historia natural y científicos que participan activamente en el monitoreo y/o gestión de datos de biodiversidad marinos.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 17 de febrero de 2023.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los alumnos admitidos para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 3 de marzo de 2023*.
- Publicación de la lista de alumnos admitidos en la página web del taller el 10 de marzo de 2023.
*Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente y la plaza pasará a la primera persona en lista de espera. Una vez se hayan confirmado todas las plazas del taller, se contactará con el resto de solicitantes comunicando la no admisión en el mismo.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Manejo de datos potencialmente publicables en GBIF.
- Que el ámbito de estudio del solicitante sea el medio marino.
- Capacidad de difusión de los contenidos del taller.
- Adscripción a una institución/instituto que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Aprovechamiento y desempeño en talleres en los que el alumno haya participado anteriormente.
Todos los materiales (vídeos y presentaciones) estarán disponibles una vez concluya el taller.
Programa
Martes, 21 de marzo de 2023
MÓDULO 0: Presentación
09:30 – 10:00
- Bienvenida e introducción al curso
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad
MÓDULO 1: CONCEPTOS GENERALES
10:00 –10:30 Introducción a la publicación de datos de biodiversidad
- Sobre la importancia de la publicación de datos de biodiversidad
- ¿Por qué publicar datos de biodiversidad?
- Tipos de datos que se pueden publicar, etc.
10:30 - 11:00 Proceso general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF
11:00 – 11:30 DESCANSO
MÓDULO 2: ESTANDARIZACIÓN Y PREPARACIÓN DE LOS DATOS PARA SU PUBLICACIÓN
11:30 – 12:00 Estándares para la información de la biodiversidad
- Estándares para la información sobre biodiversidad: un poco de contexto
- Estándares para la información sobre biodiversidad: Darwin Core
- Extensiones y Darwin Core Archive
12:00 – 13:30 Adaptación de los datos al estándar Darwin Core - Caso práctico 1
13:30 – 15:00 DESCANSO - COMIDA
15:00 – 15:30 Conceptos básicos de la calidad y limpieza de datos de biodiversidad
15:30 – 16:00 Herramientas para la validación y limpieza de datos
16:00 – 16:30 Species Matching - Herramienta para la validación de los nombres científicos - Caso práctico 2
16:30 – 17:00 Name Parser GBIF.es - Herramienta para la atomización de los nombres científicos - Caso práctico 3
17:00 – 17:30 Herramientas para la conversión de coordenadas - Caso práctico 4
17:30 – 18:00 Date Parsing - Herramienta para la normalización y separación de fechas - Caso práctico 5
MÓDULO 3: VALIDACIÓN Y MEJORA DE LA CALIDAD DE DATOS DE BIODIVERSIDAD
Miércoles, 22 de marzo de 2023
09:00 – 9:30 Validador de datos de GBIF - Caso práctico 6
MÓDULO 4: PUBLICACIÓN DE DATOS
09:30 – 10:00 Metadatos y licencias de uso de los datos
10:00 – 11:00 Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit) como herramienta de publicación
11:00 – 11:30 DESCANSO
11:30 – 12:30 Prácticas de publicación a través del IPT con datos de ejemplo - Caso práctico 7
12:30 – 13:30 Introducción a los data papers: qué son y por qué publicarlos.
13:30 – 15:00 DESCANSO - COMIDA
MÓDULO 5: PUBLICACIÓN DE ARTÍCULOS DE DATOS (“DATA PAPERS”)
15:00 – 15:30 Objetivos y estructura de un data paper
15:30 – 16:00 Del IPT al artículo de datos
16:00 – 16:30 Plataforma Arpha
16:30 – 17:30 Elaboración de un data paper con Arpha Writing Tool - Caso práctico 8
17:30 – 18:00 Discusión, conclusiones y evaluación del curso.
— evento realizado, materiales disponibles —
TallerGBIFPublicacionDatosMarinos2023
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Presentaciones
Listado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Miguel Álvarez González Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 2 Juan Carlos Arronte Prieto Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 3 María Ángeles Blanco Giner CNIEO- CO Santander
- 4 Cristina Boza Vindel Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 5 Miguel Cojan Burgos Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 6 Alejandro Isla Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 7 André Menegotto Domingos Universidad Autónoma de Madrid
- 8 Elena Moya Urbano Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 9 Lucía Rodríguez Arias Centro de Estudios Avanzados de Blanes (CEAB-CSIC)
- 10 María Helena Rodríguez Domínguez Instituto de Investigaciones Marinas de Vigo (IIM-CSIC)
- 11 María Serrano Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 12 María Olvido Tello Antón Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)
- 13 Paula Valcarce Arenas Instituto Español de Oceanografía (IEO-CSIC)