II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank
Descripción:
El avance de los estudios de biodiversidad de la mano de las técnicas moleculares y nuevos enfoques ecológicos en tiempos recientes ha sido espectacular. Sin embargo, la falta de procedimientos y prácticas para hacer las conclusiones de estos estudios revisables pone en cuestión su solidez y validez científica en muchos casos. En este contexto, la importancia de los ejemplares de colecciones como pilar del método científico en estos estudios es cada vez más reconocida y aceptada. Esta situación es una oportunidad para las colecciones, si al publicar sus datos en línea se hace con enlaces al GenBank y si se colabora con los repositorios de GenBank para que desde estos se enlace a los ejemplares de respaldo. Cómo hacerlo es el objeto de este taller.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar el formulario de inscripción hasta el 9 de mayo de 2023.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 22 de mayo de 2023*.
- Publicación de la lista de alumnos en la página web del taller el 29 de mayo de 2023.
*Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Programa
Martes 13 de junio de 2023
09:30 - 10:00
- Bienvenida e introducción al curso
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad
10:00 - 11:00
- Qué es el GenBank
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:30
- El papel de las colecciones de historia natural en los estudios moleculares - Yolanda Jiménez Ruiz
- La iniciativa "Barcode of Life" y las colecciones - Brent Emerson
13:30 - 15:00 Pausa comida
15:00 - 17:00 (30' para café)
- Implicaciones para las colecciones. Muestreos destructivos
- Principios generales y colecciones botánicas
- Aspectos específicos de las colecciones zoológicas
- Experiencias previas
- Debate: el tema de los materiales testigo, su citación: buenas y malas prácticas
Miércoles 14 de junio de 2023
9:30 - 11:00
- Las bases de datos del GenBank (presentación estructura, información que contiene, identificadores)
- Cómo tratar la información molecular en las colecciones de HN y sus implicaciones en los procedimientos de trabajo y sus bases de datos
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:00
- Cómo colaborar con GenBank para enlazar la información de las secuencias con las bases de datos en línea de las colecciones
13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del taller
- evento realizado, materiales disponibles -
tallerBasesDatosColeccionesGenBank2023
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Materiales del II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBankListado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Estrella Alfaro Saiz Herbario LEB. UNILEON
- 2 Luis Alté García-Olías Real Jardín Botánico - CSIC
- 3 Antoni Buira Clua Real Jardín Botánico - CSIC
- 4 Francisco José Cabrero Sañudo Museo de Entomología UCME - Universidad Complutense de Madrid
- 5 Marta Calvo Revuelta MNCN - CSIC
- 6 Ana Carmen de la Cruz Calleja INIA - CSIC
- 7 Francisco José García González TRAGSATEC
- 8 Javier López Llorens Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Montes, Forestal y del Medio Natural (ETSMFMN) (UPM)
- 9 Manuel Eduardo Muñoz Colmenares Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva
- 10 Eli Muñoz de los Reyes Centro Oceanográfico de Cádiz, IEO - CSIC
- 11 Manuel César Paredero García IRNASA - CSIC
- 12 Pedro José Pascual Alayón Instituto Español de Oceanografía
- 13 Sergio Rodríguez Fernández Universidad de León
- 14 Alberto Sánchez Vialas MNCN - CSIC
- 15 Laura Casas Castaño Instituto de Investigaciones Marinas (IIM-CSIC)