Taller GBIF.ES: Publicación de datos de biodiversidad en GBIF y en revistas científicas
Descripción
En este taller teórico-práctico tiene como objetivo enseñar a los participantes a elaborar, usar y publicar datos de biodiversidad a través de la red GBIF. Se abordarán aspectos relativos a la calidad, limpieza y depuración de los datos, estandarización y publicación a través de la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT) así como la preparación de manuscritos para la publicación de data papers.
El taller está dirigido a biólogos, conservadores de colecciones de historia natural y científicos que participan activamente en el monitoreo y gestión de datos de biodiversidad.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 24 de marzo.
- Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 27 de marzo de 2017.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Todos los materiales del taller (vídeos y presentaciones) están disponibles y puedes encontrarlos más abajo.
Programa
Miércoles, 26 de abril de 2017
MÓDULO 0: Presentación
09:30 – 10:00
- Bienvenida e introducción al curso - Cristina Villaverde (GBIF.ES)
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad - Felipe Castilla (GBIF.ES)
MÓDULO 1: CONCEPTOS GENERALES
10:00 –10:30 Sobre la importancia de la publicación de datos de biodiversidad - Katia Cezón (GBIF.ES)
- ¿Por qué publicar datos de biodiversidad?
- Flujo general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF
10:30 - 11:00 Flujo general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF - Katia Cezón (GBIF.ES)
11:00 – 11:30 DESCANSO
MÓDULO 2: CALIDAD Y LIMPIEZA DE DATOS DE BIODIVERSIDAD
11:30 – 12:00 Conceptos básicos de la calidad y limpieza de datos de biodiversidad (definiciones y aspectos teóricos importantes) - Néstor Beltrán (Instituto de Investigaciones Biológicas Alexander von Humboldt)
12:00 – 12:30 Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)
12:30 – 13:30 Prácticas con herramientas para la limpieza y control de la calidad de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)
- Herramientas para la gestión de nombres científicos
- Herramientas geográficas
- Herramientas para el tratamiento de las fechas
13:30 – 15:00 DESCANSO - COMIDA
15:00 – 18:00 Open Refine - Néstor Beltrán (Instituto de Investigaciones Biológicas Alexander von Humboldt)
Jueves, 27 de abril de 2017
MÓDULO 2: CALIDAD Y LIMPIEZA DE DATOS DE BIODIVERSIDAD (continuación)
09:00 – 11:00 Darwin Test - Katia Cezón (GBIF.ES)
11:00 – 11:30 DESCANSO
MÓDULO 3: PUBLICACIÓN DE DATOS
11:30 – 12:10 Conceptos básicos sobre la publicación de datos de biodiversidad en la red de GBIF: estándar de publicación, metadatos, etc. - Katia Cezón (GBIF.ES)
12:10 - 12:30 Licencias de Uso de los Datos - Ana Cruz (GBIF.ES)
12:30 – 13:30 Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit) como herramienta de publicación - Katia Cezón (GBIF.ES)
13:30 – 15:00 DESCANSO - COMIDA
15:00 – 16:30 Ejemplo guiado y prácticas de publicación a través del IPT - Katia Cezón (GBIF.ES)
- Prácticas de publicación simple (registros de biodiversidad, checklist o eventos de muestreo)
- Prácticas de publicación avanzada (mediante el uso de extensiones de información para complementar la información anterior)
16:30 - 18:00 ¿Cómo se verán los datos una vez publicados? Portal nacional de GBIF y Portal Internacional - Katia Cezón (GBIF.ES)
Viernes, 28 de abril de 2017
MÓDULO 4: PUBLICACIÓN DE ARTÍCULOS DE DATOS (“DATA PAPERS”) - David Galicia y Nora Escribano (Univ. Navarra)
09:00 – 14:00 Introducción a los data papers: qué son y por qué publicarlos.
- Del IPT al artículo de datos
- Escribir un artículo de datos
- ¿Qué secciones se generan automáticamente desde el IPT?
- ¿Qué secciones hay que incorporar manualmente?
- Editoriales y editores que publican data papers
- Ejemplos de artículos de datos
Caso práctico: elaboración de un data paper
Discusión, conclusiones y evaluación del curso
#publicacionDatos
Ver más en twitterDocumentos Adjuntos
Introducción a la publicación de datos de biodiversidad en GBIF - Katia Cezón (GBIF España) (archivo .pdf; 2,15 Mb) Flujo de publicación de los datos - Katia Cezón (GBIF España) (archivo.pdf; 1,46 Mb) Calidad y limpieza de los datos - Néstor Beltrán (Instituto Alexander von Humboldt) (archivo.pdf; 1 Mb) Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (GBIF España) (archivo.pdf; 1,86 Mb) Open Refine - Néstor Beltrán (Instituto Alexander von Humboldt) (archivo.pdf; 885 Kb) Conceptos básicos sobre la publicación de datos de biodiversidad en la red GBIF - Katia Cezón (GBIF España) (archivo.pdf; 1,27 Mb) Licencias de uso de los datos - Ana Cruz (GBIF España) (archivo.pdf; 948 Kb) Publicación de artículos de datos (Data papers) - Nora Escribano y David Galicia (Universidad de Navarra) (archivo.pdf; 772 Kb) Limpieza de datos con Open Refine - Néstor Beltrán (Instituto Alexander von Humboldt) (archivo.pdf; 1 Mb)Documentos de Interés
Open Refine Darwin Test 01.- Introducción a la Publicacion de Datos en GBIF - Katia Cezón (Youtube - 15 min.) 02.- Calidad y limpieza de los datos de biodiversidad - Néstor Beltrán (Youtube - 15 min.) 03.- Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (Youtube - 24 min.) 04.- Open Refine - Néstor Beltrán (Youtube - 4 min.) 05.- Darwin Test: primeros pasos con la aplicación - Katia Cezón (Youtube - 32 min.) 06.- DarwinTest: Validación, conversión y generalización de coordenadas - Katia Cezón (Youtube - 23 min.) 07.- DarwinTest: Edición y gestión de metadatos - Katia Cezón (Youtube - 4 min.) 08.- Publicación de datos de biodiversidad I - Katia Cezón (Youtube - 4 min.) 09.- Publicación de datos de biodiversidad II: licencias de uso - Ana Cruz (Youtube - 14 min.) 10.- Publicación de datos de biodiversidad III: Integrated Publishing Toolkit (IPT) - Katia Cezón (Youtube - 42 min.)Enlaces de Interés
http://bit.ly/2nUXm3TListado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Alfonso Herrera Bachiller Universidad de Alcalá (UAH)
- 2 Ana Carmen de la Cruz Calleja INIA - Centro de Investigación Forestal
- 3 Begoña Sánchez Chillón MNCN-CSIC
- 4 Carlos Magno Martins Vila-Vilaçosa CIBIO-InBIO, Universidade do Porto
- 5 Carmela Capistrós Bitrián Colaboradora en SEBiCoP y Biodiversidad Virtual
- 6 Filip Osaer ElasmoCan
- 7 Francisco Javier Olivas González CSIC
- 8 Grettel Vargas Azofaifa Universidad de Granada
- 9 Inmaculada González Agejas Dirección General del Agua, MAPAMA
- 10 Irene Mendoza Sagrera Universidade Estadual Paulista
- 11 Javier Ramírez Sánchez-Escobar Museu de Ciències Naturals de Barcelona (MCNB)
- 12 Jordi Agulló Villaronga Museu de Ciències Naturals de Barcelona (MCNB)
- 13 Jorge Ari Noriega MNCN-CSIC
- 14 Victoria Quiralte Palomar Instituto Geológico Minero de España (IGME)
- 15 Marta Infante Sánchez Museo de Ciencias Naturales de Álava
- 16 Ricardo Santos Bethencourt ICM-CSIC
- 17 Roger Caritg Bofill GBIF - Andorra
- 18 María Rosario Rebolé Marín Universidad de Alcalá de Henares (UAH)
- 19 Rosario Sierra de Grado Universidad de Valladolid
- 20 Silvia Guerrero García INIA
- 21 Silvia Menéndez Carrasco Museo Geominero (IGME)
- 22 Susana Soto de Matos-Pita Universidad de Vigo