Taller GBIF sobre Babilonia 2.0
Descripción:
Babilonia es una aplicación desarrollada dentro del seno de la Asociación Iberomacaronésica de Jardines Botánicos (AIMJB) para la informatización y gestión de registros almacenados en colecciones botánicas. Esta herramienta informática se ha desarrollado en un entorno Web que permite alcanzar ambos objetivos desde cualquier equipo informático con acceso a Internet.
La aplicación se ha concebido, desde sus inicios, como una base de datos en línea que permitiera el intercambio de información sobre los ejemplares registrados en instituciones botánicas. En el mejor de los casos estas instituciones están organizadas formando una red de trabajo en la que se plantean necesidades como la de conocer e intercambiar información sobre los ejemplares de herbario, de planta viva o de germoplasma que en ellas se custodian.
Babilonia se ha desarrollado en un entorno multiplataforma mediante el uso combinado del servidor de bases de datos relacionales MySQL y la programación de páginas Web en lenguaje PHP. Para su uso es necesario que la aplicación sea alojada en un servidor y de esta manera pueda hacerse accesible a la red de usuarios.
El objetivo de este curso es dar a conocer las nuevas herramientas y mejoras que se han incorporado a la v.2 de Babilonia. Si en la v.1 de Babilonia se sentaron las bases que permitían la informatización de los registros de colecciones botánicas, en esta nueva versión se ha hecho un esfuerzo por desarrollar las herramientas de gestión que permitan recoger información sobre las operaciones que son ejecutadas sobre esos ejemplares (Gestor de Operaciones). Esta herramienta se puede utilizar también sobre los registros de entrada y sobre las muestras que todavía no han pasado a formar parte de las colecciones, aumentando de este modo su funcionalidad. Junto a este aspecto en el taller se abordarán otros aspectos que tienen que ver con las mejoras realizadas en Babilonia para poder llevar a cabo un más eficiente manejo de los registros, una mejor accesibilidad a los mismos y una mayor facilidad para la depuración de errores, todo ello a partir del empleo de Tablas Temporales de Trabajo.
Este curso está dirigido a los responsables de la incorporación de datos a colecciones botánicas de planta viva, germoplasma y herbarios que necesitan contar con una herramienta que les permita interrelacionar los registros de varias colecciones de una misma institución entre sí, a la vez que controlar la trazabilidad de los registros que son incorporados a las diferentes colecciones.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones interesadas, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF y pertenezca a la Asociación Iberomacaronésica de Jardines Botánico
- Ser ya usuario de Babilonia y haber asistido a otros talleres sobre Babilonia.
- Número de solicitudes presentadas desde la misma institución.
- Orden de inscripción.
Programa
Martes 1 de marzo
9:30-09:45 Bienvenida al curso e Introducción a GBIF. Francisco Pando y Cristina Villaverde (GBIF.ES)
9:45-11:00 Presentación de Babilonia. Generalidades
- ¿Qué es Babilonia? Desarrollo. Ámbito de aplicación. Destinatarios potenciales. Babilonia v.1 y Babilonia v.2. Situación actual y perspectivas de futuro.
- ¿Qué se necesita para utilizar Babilonia? Redes de usuarios de instituciones botánicas. ¿Cómo organizarse? Servidores. Requerimientos de instalación.
- Revisión de los niveles de la información en Babilonia:
- Nivel de Información de Entradas
- Nivel de Información de Muestras
- Nivel de Información de Ejemplares
- Novedades en la ventana de usuarios: permisos de acceso a colecciones.
- Novedades en la ventana de entradas: visualización de entradas en función de la colección desde la que se crean.
- Novedades en la ventana de muestras: duplicación de muestras, bajas de muestras.
11:00-11:30 Pausa café
11:30-13:30 Uso general de las demandas y eventos de demanda. Introducción a las tablas temporales
- Eventos de demanda y demandas: ¿qué son y para qué sirven?
- Creación de eventos de demanda
- Creación de demandas
- Volcado de demandas y eventos de demanda a la tabla entradas
- Novedades en la ventana de localizaciones: gestión del árbol de localizaciones. Visualización de registros localizados en una ubicación.
- ¿Qué son las tablas temporales? Creación, edición y recuperación de tablas temporales.
- Gestión de atributos taxonómicos. Creación de atributos taxonómicos.
- Tabla temporal de nomenclatura. Tabla de nombres aceptados. Creación de tablas temporales de nomenclatura. Operaciones de inserción de atributos taxonómicos desde la tabla de nomenclatura.
13:30-15:00 Comida
15:00-16:00 Sesión práctica (Demandas y Árbol de localizaciones)
- Los participantes crearán nuevas demandas y eventos de demanda y se realizarán volcados a la tabla de entradas.
- Creación de árbol de localizaciones. Asignación de ejemplares al árbol de localizaciones y selección de ejemplares desde una ubicación. Cambios de localización de ejemplares.
16:00-18:30 (incluida pausa para café) Sesión práctica. Tablas temporales de nomenclatura y atributos taxonómicos.
- Los participantes crearán nuevos atributos taxonómicos para asignar a sus táxones.
- Se crearán nuevas tablas temporales de nomenclatura. Se practicará el guardado y edición de tablas temporales de nomenclatura.
- Los participantes asignarán atributos taxonómicos a los nombres de una tabla temporal guardada. Copiado de atributos taxonómicos de unos registros a otros.
Miércoles 2 de marzo
9:30-11:00 Tablas temporales de entradas y muestras
- Creación de tablas temporales de registros de entrada. Ejemplos de funcionalidades. Edición masiva de entradas.
- Creación de tablas temporales de muestras. Ejemplos de funcionalidades. Edición masiva de muestras.
11:00-11:30 Pausa café
11:30-13:00 Tablas temporales de ejemplares
- Generación de tablas temporales de ejemplares. Revisión de sitios desde los que incorporar ejemplares a las tablas temporales.
- Generación de atributos de ejemplares y asignación de atributos a ejemplares desde las tablas temporales. Ejemplos y casos de uso.
- Uso de las tablas temporales de ejemplares para la edición masiva
13:30-15:00 Comida
15:00-18:30 (incluida pausa para café) Sesión práctica. Tablas temporales de entradas, muestras y ejemplares de colección.
- Los participantes crearán tablas temporales de los diferentes tipos y realizarán operaciones de edición sobre ellas.
- Se realizarán prácticas para la creación de atributos de ejemplares y se asignarán a través del uso de tablas temporales.
Jueves 3 de marzo
9:30-11:00 Gestor de operaciones
- Generación de tipos de operación y creación de campos para recogida de información.
- Generación de protocolos para cada tipo de operación.
- Creación de operaciones. Ventana de listado de operaciones.
11:00-11:30 Pausa café
11:30-13:30 Sesión práctica. Gestor de operaciones
- Los asistentes crearán nuevas operaciones en función de sus necesidades y guardarán los datos de una operación realizada sobre ejemplares, muestras o entradas.
- Evaluación del taller.
Documentos Adjuntos
Formulario de inscripciónDocumentos de Interés
GBIF y la información primaria sobre biodiversidad. Cristina Villaverde (archivo .pdf; 1.6 Mb) Manual de Babilonia versión 1. Eventos de Entrada en Babilonia - Ignacio Alonso (vídeo Youtube) Operaciones con Muestras en Babilonia - Ignacio Alonso (vídeo Youtube) Gestor de Localizaciones en Babilonia - Ignacio Alonso (vídeo Youtube) Gestores de Atributos Taxonómicos en Babilonia - Ignacio Alonso (vídeo Youtube)Enlaces de Interés
http://www.aimjb.net/babilonia/
Listado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Silvia Villegas Navarro CSIC-Real Jardín Botánico
- 2 Inmaculada Porras Castillo Real Jardín Botánico Juan Carlos I
- 3 Silvia Rivas Real Jardín Botánico Juan Carlos I
- 4 Gloria Muñoz Linares Universidad de Granada, Servicio de Herbario de la Universidad de Granada [Herbario]
- 5 Nuria Prieto Ruiz CSIC-Real Jardín Botánico
- 6 Agustí Agut i Escrig Jardín Botánico de Olarizu (Vitoria-Gasteiz)/Olarizuko Lorategi Botanikoa (Vitoria-Gasteiz)
- 7 Núria Membrives-Fernàndez Fundación "Karl Faust". Estación Internacional de Biología Mediterranea-Jardín Botánico Marimurtra
- 8 David Draper Munt Banco de Germoplasma Vegetal Universidad Politécnica de Madrid
- 9 Sara Mira Pérez Banco de Germoplasma Vegetal Universidad Politécnica de Madrid
- 10 Mariano Zarzuela Esteban Banco de Germoplasma Vegetal Universidad Politécnica de Madrid
- 11 Jaime Güemes Heras Jardín Botánico de la Universidad de Valencia
- 12 Mayra Aguado López Universidad Politécnica de Cartagena
- 13 David García San León Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario]
- 14 Luis Guillermo Torres Sanjuán Estación Biológica de Doñana (CSIC)
- 15 Susana Noriega Iglesias Jardín Botánico Atlántico
- 16 Jesús Iván Sanzo Rodríguez Jardín Botánico Atlántico
- 17 Juan de Dios García CSIC-Real Jardín Botánico