VI Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad
Descripción:
Este taller está dirigido a profesionales y científicos que trabajan con especímenes de colecciones de historia natural y en proyectos de investigación sobre biodiversidad, que estén interesados en el tratamiento y la publicación en Internet de imágenes digitales, preferentemente en el ámbito de GBIF.
Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.
Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.
IMPORTANTE: Es conveniente que los alumnos aporten sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto, así como sus propios ejemplares para fotografiar para tratar de resolver los problemas que se presenten.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
- Orden de inscripción.
Con la colaboración de la Universidad de Navarra.
Programa
PARTE I: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES DE BIODIVERSIDAD EN INTERNET. Francisco Pando
Miércoles 26
15:00 – 16:30
- Bienvenida e introducción al curso. GBIF y la información primaria sobre biodiversidad. [Virginia González]
- Proyectos y bibliotecas digitales en Internet (Flora brasiliensis, Herbario de Berlín, Morphobank, etc).
- Servidores de imágenes (eRez, IIPImage) vs Repositorio de imágenes.
- Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).
- Servicio de alojamiento y publicación de imágenes de GBIF.ES.
- Integración del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes en la infraestructura de GBIF.ES y de GBIF (protocolos, estándares, portales).
16:30- 17:00 Pausa para café
17:00-19:00
- Protocolo de uso del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes e integración en la red de GBIF. Ejemplo de uso: "Proyecto de digitalización de los dibujos de la Real Expedición Botánica del Nuevo Reino de Granada (1783-1816), dirigida por José Celestino Mutis"
- Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
- Caso práctico I: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos con el visualizador zoomyfer y publicación en nuestra web.
- Caso práctico II: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos en el Servicio de Alojamiento de imágenes de GBIF.ES y publicación en nuestra web.
PARTE II: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL.
Arturo H. Ariño y David Galicia.
Jueves 27
10:00-11:00 – Sesión introductoria: Teoría de la imagen digital
- Nociones básicas sobre imagen
- Naturaleza de la luz
- Óptica y formación de la imagen
- Teoría del Color
- Captura de una imagen
- Señal analógica y digital
- Sensores digitales y respuesta electrónica
- Requisitos de captura
- Sistemas de imagen digital
- Componentes ópticos y electrónicos
- Equipos de tratamiento de imagen
- Software de análisis
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Adquisición de imagen.
- Fotografiado de especímenes bidimensionales
- Ejemplares zoológicos bidimensionales
- Plantas de herbario
- Láminas, papel, documentos
- Fotografiado de especímenes tridimensionales
- Sistemas y modos de iluminación
- Planos y ángulos de imagen
- Ejemplares de tamaño medio y grande
- Ejemplares para macrofotografía con SLR
- Motorización
- Captura 3D
- Fotomicroscopía
- Ejemplares para macrofotografía con estereomicroscopio
- Microfotografía y técnicas de contraste
- Casos especiales
- Cajas de colección
- Material en líquido
- Imagen morfométrica
- Especímenes transparentes y brillantes
- Imagen para clasificación automática
- Foto
13:30-15:00 Pausa para comer
15:00-16:45 – Sesión teórico-práctica: Prevención de problemas en la imagen
- Problemas fotográficos
- Resolución
- Color
- Geometría
- Artefactos
16:45-17:15 – Pausa para café
17:15-18:00
- Problemas informáticos
- Pérdida de información
- Conservación, archivo y durabilidad
- Costes
- Compatibilidad de formato
- Análisis automático de imagen
Viernes 28
09:30-11:00 – Fotografiado de ejemplares de los alumnos
En esta sesión, por turnos y por grupos de casos, los alumnos fotografiarán sus ejemplares de acuerdo a los criterios estudiados el día anterior. Los alumnos que no estén en el laboratorio tomando las fotos analizarán y criticarán las imágenes del otro grupo, así como las de muestra propuestas por los profesores o las que hayan traído consigo. En la sesión siguiente se abordará el postprocesado, corrección digital y realce.
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Postprocesado y análisis de imagen. Corrección.
- Procesos generales de la imagen
- Reencuadre y recorte de imagen
- Redimensionamiento
- Ajuste de gama dinámica
- Corrección cromática
- Corrección geométrica
- Limpieza digital
- Ajuste de la nitidez
- Retoque fotográfico
- Tratamientos parciales en la imagen
- Segmentación
- Filtros
- Combinaciones de imágenes
- Algebra de imagen
- Montaje fotográfico
- Stacks, Automontaje y Extensión de foco
- Extensión de gama dinámica
13:30h–15:00 – Pausa para comer
15:00-18:00 – Sesión flexible con tiempo para continuar el fotografiado de ejemplares problema y tratamiento de formatos de imagen y metadatos.
- Formatos de imagen
- Formatos digitales sin pérdida
- Formatos de compresión con pérdida única
- Formatos de compresión con pérdida acumulativa y flexibles
- Metadatos
- EXIF
- Bases de datos de imagen
- Historial de proceso
- Documentación
- IPR
- Trazabilidad