VI Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad

PARTE I: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL.
Arturo H. Ariño y David Galicia.

Martes 15

09:30-10:00 Bienvenida e introducci&oacuten al curso. GBIF y la informaci&oacuten primaria sobre biodiversidad.

10:00-11:00 – Sesión introductoria: Teoría de la imagen digital

• Nociones básicas sobre imagen
  • Naturaleza de la luz
  • Óptica y formación de la imagen
  • Teoría del Color
• Captura de una imagen
  • Señal analógica y digital
  • Sensores digitales y respuesta electrónica
  • Requisitos de captura
• Sistemas de imagen digital
  • Componentes ópticos y electrónicos
  • Equipos de tratamiento de imagen
  • Software de análisis

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Adquisición de imagen.

• Fotografiado de especímenes bidimensionales
  • Ejemplares zoológicos bidimensionales
  • Plantas de herbario
  • Láminas, papel, documentos
• Fotografiado de especímenes tridimensionales
  • Sistemas y modos de iluminación
  • Planos y ángulos de imagen
  • Ejemplares de tamaño medio y grande
  • Ejemplares para macrofotografía con SLR
  • Motorización
  • Captura 3D
• Fotomicroscopía
  • Ejemplares para macrofotografía con estereomicroscopio
  • Microfotografía y técnicas de contraste
• Casos especiales
  • Cajas de colección
  • Material en líquido
  • Imagen morfométrica
  • Especímenes transparentes y brillantes
  • Imagen para clasificación automática
  • Foto

13:30-15:00 Pausa para comer

15:00-16:45 – Sesión teórico-práctica: Prevención de problemas en la imagen

• Problemas fotográficos
  • Resolución
  • Color
  • Geometría
  • Artefactos

16:45-17:15 – Pausa para café

17:15-18:00

• Problemas informáticos
  • Pérdida de información
  • Conservación, archivo y durabilidad
  • Costes
  • Compatibilidad de formato
  • Análisis automático de imagen

Miércoles 16

09:30-11:00 – Fotografiado de ejemplares de los alumnos

En esta sesión, por turnos y por grupos de casos, los alumnos fotografiarán sus ejemplares de acuerdo a los criterios estudiados el día anterior. Los alumnos que no estén en el laboratorio  tomando las fotos analizarán y criticarán las imágenes del otro grupo, así como las de muestra propuestas por los profesores o las que hayan traído consigo. En la sesión siguiente se abordará el postprocesado, corrección digital y realce.

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Postprocesado y análisis de imagen. Corrección.

• Procesos generales de la imagen
  • Reencuadre y recorte de imagen
  • Redimensionamiento
  • Ajuste de gama dinámica
  • Corrección cromática
  • Corrección geométrica
  • Limpieza digital
  • Ajuste de la nitidez
• Retoque fotográfico
  • Tratamientos parciales en la imagen
  • Segmentación
  • Filtros
• Combinaciones de imágenes
  • Algebra de imagen
  • Montaje fotográfico
  • Stacks, Automontaje y Extensión de foco
  • Extensión de gama dinámica

13:30–15:00 – Pausa para comer

15:00-18:00 – Sesión flexible con tiempo para continuar el fotografiado de ejemplares problema y tratamiento de formatos de imagen y metadatos.

• Formatos de imagen
  • Formatos digitales sin pérdida
  • Formatos de compresión con pérdida única
  • Formatos de compresión con pérdida acumulativa y flexibles
• Metadatos
  • EXIF
  • Bases de datos de imagen
  • Historial de proceso
  • Documentación
  • IPR
  • Trazabilidad

Jueves 17

PARTE II: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES DE BIODIVERSIDAD EN INTERNET. Francisco Pando

09:30-11:00

• Proyectos y bibliotecas digitales en Internet (Flora brasiliensis, Herbario de Berlín, Morphbank, etc).
• Servidores de imágenes (eRez, IIPImage) vs Repositorio de imágenes.
• Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).
• Servicio de alojamiento y publicación de imágenes de GBIF.ES.
• Integración del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes en la infraestructura de GBIF.ES y de GBIF (protocolos, estándares, portales).

11:00-11:30 Pausa para café

11:30-13:30

• Protocolo de uso del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes e integración en la red de GBIF. Ejemplo de uso con catálogos de imágenes ya cargados en GBIF-ES.
• Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
• • Caso práctico I: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos con el visualizador zoomyfer y publicación en nuestra web.
  • Caso práctico II: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos en el Servicio de Alojamiento de imágenes de GBIF.ES y publicación en nuestra web.