III Taller GBIF sobre migración de datos de biodiversidad
Descripción:
Poner los datos de biodiversidad en formato electrónico es la tarea más costosa de los procesos encaminados a su uso y análisis. Sin embargo, «que los datos estén en el ordenador» no basta para que se puedan usar o gestionar adecuadamente; tareas como publicación de datos en internet, unificación de bases de datos, o adaptación a nuevos sistemas de gestión, análisis o visualización suelen exigir que se transformen de una u otra manera.
Este taller pasa revista a las herramientas y técnicas necesarias a la hora de transformar datos específicos sobre biodiversidad, con especial énfasis en nombres científicos, coordenadas geográficas y fechas, y dentro del marco de las actividades y objetivos de GBIF.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Aunque los procedimientos y técnicas que se verán en el taller son independientes del sistema de base de datos, ordenador o sistema operativo que se emplee, las herramientas y casos prácticos se trabajarán sobre MS-Access en entorno Windows, en continua referencia al estándar de GBIF Darwin Core y a las herramientas desarrolladas y soportadas por la Unidad de Coordinación de GBIF.
Se darán por sabidos los conceptos básicos sobre bases de datos y será necesario revisar material previo a la realización del taller.
Programa
PROGRAMA
Martes, 19 febrero 2013
09:30 - 11:00
- Bienvenida e introducción al curso.
- GBIF e información primaria sobre biodiversidad.
- Conceptos generales sobre Access y bases de datos relacionales.
11:00 - 11:30 - Pausa para café.
11:30 – 12:30
- Consultas de Access. Tipos, características.
- Funciones de Access.
- Consultas: uso de funciones y columnas calculadas.
12:30– 13:30 Manipulación de campos de nombres científicos
- Caso práctico 1
13:30 - 15:00 - Comida.
15:00 - 15:30 Name Parser
- Caso práctico 2
15:30 – 16:30 Transformación de coordenadas
- Caso práctico 3
16:30 - 17:00 - Pausa para café.
17:00 - 18:00 Atomización y normalización de fechas
- Caso práctico 4
Miércoles, 20 febrero 2013
09:00 - 11:00 Normalización
- Caso práctico 5: caso guiado.
- Caso práctico 6: caso libre
11:00 - 11:30 - Pausa para café
11:30-13:30 Migración de bases de datos
- Caso práctico 7
13:30 - 15:00 - Comida.
15:00 - 16:15 Migración de bases de datos (cont.)
- Caso Práctico 8
16:15 - 16:45 - Pausa para café.
16:45 - 18:00
- Evaluaciones, repaso, aclaración de dudas y cierre del curso
- Casos de los alumnos
Documentos de Interés
Guión del taller (archivo .doc; 96Kb) Guión de ejercicios del taller (archivo .doc; 58 Kb) GBIF y la información primaria sobre biodiversidad. Cristina Villaverde (archivo .pdf; 1.3 Mb). Funciones de Herbar (archivo .doc; 47 Kb) Funciones generales de MS Access (archivo .doc; 233Kb) Base de datos Mapeos tablas (archivo.mdb; 5.4 Mb) Base de datos Mapeos toolkit (archivo.mdb; 840 Kb) Base de datos Colección ejemplo_CEUA (archivo.mdb; 1.1 Mb) Base de datos ejemplo Agaricales (archivo.mdb; 1.3 Mb)Enlaces de Interés
https://old.gbif.es/software/herbar-zoorbar/ https://old.gbif.es/software/bibmaster/ https://old.gbif.es/wp-content/uploads/2018/04/Name_Parser.zip https://es.wikipedia.org/wiki/Base_de_datos_relacionalListado de Participantes
- Nº Nombre Organización
- 1 Pilar Ríos López Centro Oceanográfico de Gijón. Instituto Español de Oceanografía.
- 2 Jean Mattos Reaño Museo de Historia Natural de Lima - Perú
- 3 Marta Espinosa Sánchez Universidad de Extremadura, Dpto. Biología y Producción Vegetal. [Herbario]
- 4 Elena Moreno Amat Universidad Politécnica de Madrid
- 5 Marta Fernández Albert CSIC-Real Jardín Botánico
- 6 Joaquina María García Martín CSIC-Real Jardín Botánico
- 7 Antonio Torralba Burrial Universidad de Oviedo
- 8 Cinta Quirce Vázquez CIBIO - Universidad de Alicante